MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Riesia pediculicola USDA chromosome

Total Repeats: 13124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014109	A	6	6	749	754	100 %	0 %	0 %	0 %	295698241
2	NC_014109	GTAA	2	8	755	762	50 %	25 %	25 %	0 %	295698241
3	NC_014109	ACT	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698241
4	NC_014109	GAA	2	6	833	838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698241
5	NC_014109	A	8	8	883	890	100 %	0 %	0 %	0 %	295698241
6	NC_014109	ATT	2	6	908	913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698241
7	NC_014109	GTT	2	6	981	986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698241
8	NC_014109	AGA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698241
9	NC_014109	GAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698241
10	NC_014109	GAT	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698241
11	NC_014109	GGA	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295698241
12	NC_014109	ATT	2	6	1202	1207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698241
13	NC_014109	T	6	6	1209	1214	0 %	100 %	0 %	0 %	295698241
14	NC_014109	A	6	6	1217	1222	100 %	0 %	0 %	0 %	295698241
15	NC_014109	T	6	6	1226	1231	0 %	100 %	0 %	0 %	295698241
16	NC_014109	A	7	7	1233	1239	100 %	0 %	0 %	0 %	295698241
17	NC_014109	A	6	6	1266	1271	100 %	0 %	0 %	0 %	295698241
18	NC_014109	T	8	8	2012	2019	0 %	100 %	0 %	0 %	295698242
19	NC_014109	ATTA	2	8	2022	2029	50 %	50 %	0 %	0 %	295698242
20	NC_014109	AGAA	2	8	2055	2062	75 %	0 %	25 %	0 %	295698242
21	NC_014109	A	6	6	2076	2081	100 %	0 %	0 %	0 %	295698242
22	NC_014109	TCC	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295698242
23	NC_014109	TTTC	2	8	2239	2246	0 %	75 %	0 %	25 %	295698242
24	NC_014109	CTA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698242
25	NC_014109	TTC	2	6	2340	2345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698242
26	NC_014109	GAG	2	6	2411	2416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295698242
27	NC_014109	TGT	2	6	2445	2450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698242
28	NC_014109	GTA	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698242
29	NC_014109	TTTTC	2	10	2503	2512	0 %	80 %	0 %	20 %	295698242
30	NC_014109	TAA	2	6	2547	2552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698242
31	NC_014109	T	9	9	2557	2565	0 %	100 %	0 %	0 %	295698242
32	NC_014109	T	7	7	2593	2599	0 %	100 %	0 %	0 %	295698242
33	NC_014109	A	6	6	2625	2630	100 %	0 %	0 %	0 %	295698242
34	NC_014109	TAT	2	6	2651	2656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698242
35	NC_014109	CAT	2	6	2672	2677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698242
36	NC_014109	AAT	2	6	2680	2685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698242
37	NC_014109	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	295698242
38	NC_014109	T	7	7	2718	2724	0 %	100 %	0 %	0 %	295698242
39	NC_014109	AATA	2	8	2726	2733	75 %	25 %	0 %	0 %	295698242
40	NC_014109	AAG	2	6	2748	2753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698242
41	NC_014109	A	6	6	2785	2790	100 %	0 %	0 %	0 %	295698242
42	NC_014109	TATC	2	8	2906	2913	25 %	50 %	0 %	25 %	295698243
43	NC_014109	TCT	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698243
44	NC_014109	AAT	2	6	2967	2972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698243
45	NC_014109	TAA	2	6	2997	3002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698243
46	NC_014109	CTC	3	9	3026	3034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295698243
47	NC_014109	AT	3	6	3059	3064	50 %	50 %	0 %	0 %	295698243
48	NC_014109	TAA	2	6	3165	3170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698243
49	NC_014109	CTT	2	6	3175	3180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698243
50	NC_014109	TGAT	2	8	3234	3241	25 %	50 %	25 %	0 %	295698243
51	NC_014109	CTG	2	6	3272	3277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698243
52	NC_014109	TCT	2	6	3306	3311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698243
53	NC_014109	TCA	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698243
54	NC_014109	TCC	2	6	3345	3350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295698243
55	NC_014109	AGA	3	9	3360	3368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698243
56	NC_014109	AGT	2	6	3405	3410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698243
57	NC_014109	CCT	2	6	3415	3420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295698243
58	NC_014109	AGC	2	6	3474	3479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698243
59	NC_014109	TTC	2	6	3489	3494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698243
60	NC_014109	CT	3	6	3507	3512	0 %	50 %	0 %	50 %	295698243
61	NC_014109	TTC	2	6	3722	3727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698243
62	NC_014109	TATTTT	2	12	4327	4338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	295698244
63	NC_014109	T	7	7	4369	4375	0 %	100 %	0 %	0 %	295698244
64	NC_014109	AT	3	6	4388	4393	50 %	50 %	0 %	0 %	295698244
65	NC_014109	CT	3	6	4412	4417	0 %	50 %	0 %	50 %	295698244
66	NC_014109	A	6	6	4462	4467	100 %	0 %	0 %	0 %	295698245
67	NC_014109	A	6	6	4483	4488	100 %	0 %	0 %	0 %	295698245
68	NC_014109	AGA	2	6	4558	4563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698245
69	NC_014109	ATC	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698245
70	NC_014109	A	7	7	4606	4612	100 %	0 %	0 %	0 %	295698245
71	NC_014109	TTTC	2	8	4650	4657	0 %	75 %	0 %	25 %	295698245
72	NC_014109	TCAT	2	8	4688	4695	25 %	50 %	0 %	25 %	295698245
73	NC_014109	AAG	2	6	4705	4710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698245
74	NC_014109	ATTTT	2	10	4715	4724	20 %	80 %	0 %	0 %	295698245
75	NC_014109	ATCTT	2	10	4848	4857	20 %	60 %	0 %	20 %	295698245
76	NC_014109	GTTA	2	8	4953	4960	25 %	50 %	25 %	0 %	295698245
77	NC_014109	TA	3	6	4959	4964	50 %	50 %	0 %	0 %	295698245
78	NC_014109	GAA	2	6	4965	4970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698245
79	NC_014109	A	6	6	5004	5009	100 %	0 %	0 %	0 %	295698246
80	NC_014109	GAAATT	2	12	5042	5053	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295698246
81	NC_014109	TAA	2	6	5070	5075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698246
82	NC_014109	GAAG	2	8	5149	5156	50 %	0 %	50 %	0 %	295698246
83	NC_014109	GAAA	2	8	5162	5169	75 %	0 %	25 %	0 %	295698246
84	NC_014109	ATA	2	6	5193	5198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698246
85	NC_014109	ATT	2	6	5225	5230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698246
86	NC_014109	A	6	6	5301	5306	100 %	0 %	0 %	0 %	295698246
87	NC_014109	AATC	2	8	5369	5376	50 %	25 %	0 %	25 %	295698246
88	NC_014109	TGT	2	6	5413	5418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698246
89	NC_014109	GA	3	6	5494	5499	50 %	0 %	50 %	0 %	295698247
90	NC_014109	ATAG	2	8	5565	5572	50 %	25 %	25 %	0 %	295698247
91	NC_014109	TTA	2	6	5589	5594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698247
92	NC_014109	ATT	2	6	5658	5663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698247
93	NC_014109	ATCC	2	8	5694	5701	25 %	25 %	0 %	50 %	295698247
94	NC_014109	ATA	2	6	5787	5792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698247
95	NC_014109	AAATA	2	10	5804	5813	80 %	20 %	0 %	0 %	295698247
96	NC_014109	A	7	7	5832	5838	100 %	0 %	0 %	0 %	295698247
97	NC_014109	TGA	2	6	5876	5881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698247
98	NC_014109	AAT	2	6	5892	5897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698247
99	NC_014109	AGGAT	2	10	5913	5922	40 %	20 %	40 %	0 %	295698247
100	NC_014109	AGG	3	9	5948	5956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295698247
101	NC_014109	TGT	2	6	5972	5977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698247
102	NC_014109	ATG	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698247
103	NC_014109	TA	3	6	6055	6060	50 %	50 %	0 %	0 %	295698247
104	NC_014109	AAT	2	6	6075	6080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698247
105	NC_014109	TCTG	3	12	6130	6141	0 %	50 %	25 %	25 %	295698247
106	NC_014109	GAA	2	6	6183	6188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698247
107	NC_014109	A	6	6	6197	6202	100 %	0 %	0 %	0 %	295698247
108	NC_014109	AAAG	2	8	6207	6214	75 %	0 %	25 %	0 %	295698247
109	NC_014109	AATTA	2	10	6259	6268	60 %	40 %	0 %	0 %	295698247
110	NC_014109	GAT	2	6	6365	6370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698247
111	NC_014109	CAAG	2	8	6431	6438	50 %	0 %	25 %	25 %	295698247
112	NC_014109	AGA	2	6	6485	6490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698247
113	NC_014109	TC	3	6	6502	6507	0 %	50 %	0 %	50 %	295698247
114	NC_014109	CAT	2	6	6597	6602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698247
115	NC_014109	A	7	7	6726	6732	100 %	0 %	0 %	0 %	295698247
116	NC_014109	TCA	2	6	6765	6770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698247
117	NC_014109	AAG	2	6	6854	6859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698248
118	NC_014109	T	7	7	6878	6884	0 %	100 %	0 %	0 %	295698248
119	NC_014109	CAG	2	6	6917	6922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698248
120	NC_014109	TC	3	6	6956	6961	0 %	50 %	0 %	50 %	295698248
121	NC_014109	T	7	7	6983	6989	0 %	100 %	0 %	0 %	295698248
122	NC_014109	GAT	2	6	6990	6995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698248
123	NC_014109	CTT	2	6	7003	7008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698248
124	NC_014109	A	6	6	7083	7088	100 %	0 %	0 %	0 %	295698248
125	NC_014109	TCT	2	6	7102	7107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698248
126	NC_014109	A	6	6	7129	7134	100 %	0 %	0 %	0 %	295698248
127	NC_014109	TCT	2	6	7153	7158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698248
128	NC_014109	T	6	6	7218	7223	0 %	100 %	0 %	0 %	295698248
129	NC_014109	T	6	6	7236	7241	0 %	100 %	0 %	0 %	295698248
130	NC_014109	TTC	2	6	7292	7297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698248
131	NC_014109	GAA	2	6	7305	7310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698248
132	NC_014109	TGT	2	6	7329	7334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698248
133	NC_014109	AT	3	6	7366	7371	50 %	50 %	0 %	0 %	295698248
134	NC_014109	AATG	2	8	7394	7401	50 %	25 %	25 %	0 %	295698248
135	NC_014109	TCA	2	6	7454	7459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698248
136	NC_014109	CTT	2	6	7472	7477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698248
137	NC_014109	AAT	2	6	7511	7516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698248
138	NC_014109	T	6	6	7516	7521	0 %	100 %	0 %	0 %	295698248
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270	NC_014109	T	6	6	12336	12341	0 %	100 %	0 %	0 %	295698253
271	NC_014109	AAT	2	6	12412	12417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295698253
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